Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm44749-201ENSMUST00000206285 1628 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf166Q3U9F6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf166Q3U9F6 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf166Q3U9F6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf166Q3U9F6 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf166Q3U9F6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf166Q3U9F6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rnf166Q3U9F6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Trp63-206ENSMUST00000115307 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm16559-201ENSMUST00000160080 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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