Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms