Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms