Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms