Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Slc25a13-201ENSMUST00000015256 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm16059-201ENSMUST00000135583 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Prpf31-206ENSMUST00000179769 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cbx1P83917 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cbx1P83917 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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