Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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