Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms