Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms