Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtpreP49446 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtpreP49446 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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