Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp4P35123 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp4P35123 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp4P35123 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp4P35123 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp4P35123 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp4P35123 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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