Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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