Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P10404 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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P10404 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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