Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01667 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01667 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01667 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms