Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms