Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms