Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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Gm21976J3QNN2 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Gm21976J3QNN2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Gm21976J3QNN2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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