Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms