Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r167G3UW71 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms