Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms