Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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