Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ssxb8B1AY40 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ssxb8B1AY40 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ssxb8B1AY40 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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