Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NhsB1AV60 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms