Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Atp8b5A3FIN4 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Atp8b5A3FIN4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Atp8b5A3FIN4 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Atp8b5A3FIN4 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Atp8b5A3FIN4 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Atp8b5A3FIN4 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms