Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vamp5Q9Z2P8 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms