Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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