Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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