Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bhlhe41Q99PV5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms