Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ubqln4Q99NB8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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