Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gps1Q99LD4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gps1Q99LD4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms