Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Depp1Q8K2F3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Depp1Q8K2F3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms