Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ccdc187Q8C5V8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc187Q8C5V8 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms