Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crb2Q80YA8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms