Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms