Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg9aQ68FE2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms