Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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PtprdQ64487 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprdQ64487 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprdQ64487 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprdQ64487 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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