Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms