Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms