Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms