Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.6 ms