Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pde1bQ01065 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pde1bQ01065 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pde1bQ01065 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pde1bQ01065 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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