Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 D930048N14Rik-201ENSMUST00000064493 3426 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Trpm1-202ENSMUST00000177102 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm42868-201ENSMUST00000199168 2697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cbx1P83917 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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