Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Hoxd13P70217 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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