Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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