Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cd28P31041 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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