Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 309.7 ms