Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TP20293 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TP20293 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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