Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms