Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lnx1O70263 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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