Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms