Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28048F7BCN0 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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